NucleaRDB 2F3 Seven-up (SVP)
2005, NucleaRDB.
SEQLENGTH 543
NALIGN 2
REMARK : WARNING: This alignment was generated fully automatically.
REMARK : It therefore highly likely that this alignment contains errors.
REMARK : We give no guarantees and can not be held responsible for errors.
REMARK : Small characters indicate insertions in the sequences relative
REMARK : to the profile ocurred.
Date= 2005-04-20 19:48:34
NOTATION : NR : Number of the sequence in the database.
NOTATION : ID : Identifier of the sequence.
NOTATION : STRID : Not relevant in this case.
NOTATION : %ID : Percent of residues identical with the consensus sequence.
NOTATION : %SIM : Convolution of sequence with profile
NOTATION : IFIR,ILAS : Not used.
NOTATION : JFIR,JLAS : Not used.
NOTATION : LALI : Not used.
NOTATION : NGAP : Not used.
NOTATION : LGAP : Not used.
NOTATION : LSEQ2 : Total length of the seq.
NOTATION : SEQW : Weight of the seq.
## PROTEINS : EMBL/SWISSPROT identifier and alignment statistics
NR. ID %IDE %SIM IFIR ILAS JFIR JLAS LALI NGAP LGAP LSEQ2 ACCNUM SEQW PROTEIN
1 : 7UP1_DROME 0.96 1.00 0 0 0 0 0 0 0 543 P16375 1.0000 svp -- Steroid receptor seven-up, isoforms B/C.
2 : 7UP2_DROME 0.90 0.96 0 0 0 0 0 0 0 746 P16376 1.0000 svp -- Steroid receptor seven-up, isoform A.
## ALIGNMENTS 1 - 2
SeqNo PDBNo AA STRUCT Gap-O Gap-E ACC NOCC VAR ....:....1....:....2....:....3....:....4....:....5....:....6....:....7
1 0 M 1.23 0.06 2 100 MM
2 0 C 1.23 0.06 2 100 CC
3 0 A 1.23 0.06 2 100 AA
4 0 S 1.26 0.07 2 100 SS
5 0 P 1.27 0.07 2 100 PP
6 0 S 1.27 0.07 2 100 SS
7 0 T 1.27 0.07 2 100 TT
8 0 A 1.27 0.06 2 100 AA
9 0 P 1.26 0.06 2 100 PP
10 0 G 1.27 0.07 2 100 GG
11 0 F 1.27 0.06 2 100 FF
12 0 F 1.26 0.06 2 100 FF
13 0 N 1.27 0.07 2 100 NN
14 0 P 1.27 0.06 2 100 PP
15 0 R 1.27 0.06 2 100 RR
16 0 P 1.25 0.06 2 100 PP
17 0 Q 1.26 0.06 2 100 QQ
18 0 S 1.23 0.05 2 100 SS
19 0 G 1.27 0.06 2 100 GG
20 0 A 1.25 0.06 2 100 AA
21 0 E 1.27 0.06 2 100 EE
22 0 L 1.25 0.06 2 100 LL
23 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
24 0 A 1.26 0.06 2 100 AA
25 0 F 1.25 0.06 2 100 FF
26 0 D 1.26 0.06 2 100 DD
27 0 I 1.26 0.06 2 100 II
28 0 G 1.26 0.06 2 100 GG
29 0 L 1.25 0.06 2 100 LL
30 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
31 0 R 1.27 0.06 2 100 RR
32 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
33 0 M 1.27 0.06 2 100 MM
34 0 G 1.26 0.06 2 100 GG
35 0 L 1.27 0.06 2 100 LL
36 0 G 1.25 0.06 2 100 GG
37 0 V 1.26 0.06 2 100 VV
38 0 P 1.27 0.07 2 100 PP
39 0 P 1.27 0.06 2 100 PP
40 0 H 1.27 0.06 2 100 HH
41 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
42 0 A 1.27 0.07 2 100 AA
43 0 W 1.26 0.06 2 100 WW
44 0 H 1.26 0.06 2 100 HH
45 0 E 1.25 0.06 2 100 EE
46 0 P 1.26 0.06 2 100 PP
47 0 P 1.23 0.05 2 100 PP
48 0 A 1.26 0.06 2 100 AA
49 0 S 1.25 0.06 2 100 SS
50 0 L 1.27 0.06 2 100 LL
51 0 G 1.27 0.06 2 100 GG
52 0 G 1.26 0.06 2 100 GG
53 0 H 1.27 0.07 2 100 HH
54 0 L 1.26 0.06 2 100 LL
55 0 H 1.25 0.06 2 100 HH
56 0 A 1.26 0.06 2 100 AA
57 0 A 1.25 0.06 2 100 AA
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60 0 G 1.22 0.05 2 100 GG
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65 0 T 1.25 0.05 2 100 TT
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105 0 H 1.21 0.05 2 100 HH
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128 0 H 1.25 0.06 2 100 HH
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130 0 G 1.27 0.06 2 100 GG
131 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
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133 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
134 0 G 1.25 0.06 2 100 GG
135 0 S 1.25 0.06 2 100 SS
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180 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
181 0 S 1.25 0.06 2 100 SS
182 0 H 1.26 0.06 2 100 HH
183 0 S 1.26 0.06 2 100 SS
184 0 Q 1.25 0.06 2 100 QQ
185 0 S 1.22 0.05 2 100 SS
186 0 S 1.23 0.05 2 100 SS
187 0 N 1.25 0.06 2 100 NN
188 0 S 1.23 0.05 2 100 SS
189 0 G 1.28 0.07 2 100 GG
190 0 S 1.32 0.07 2 100 SS
191 0 Q 1.45 0.07 2 100 QQ
192 0 I 1.32 0.07 2 100 II
193 0 D 1.45 0.08 2 100 DD
194 0 S 1.35 0.07 2 100 SS
195 0 K 1.29 0.07 2 100 KK
196 0 Q 1.27 0.07 2 100 QQ
197 0 N 1.27 0.07 2 100 NN
198 0 I 1.26 0.07 2 100 II
199 0 E 1.01 0.10 2 100 EE
200 D001 C 8.00 0.40 2 100 CC
201 D002 V 8.00 0.40 2 100 VV
202 D003 V 8.00 0.40 2 100 VV
203 D004 C 8.00 0.40 2 100 CC
204 D005 G 8.00 0.40 2 100 GG
205 D006 D 8.00 0.40 2 100 DD
206 D007 K 8.00 0.40 2 100 KK
207 D008 S 8.00 0.40 2 100 SS
208 D009 S 8.00 0.40 2 100 SS
209 D010 G 8.00 0.40 2 100 GG
210 D011 K 8.00 0.40 2 100 KK
211 D012 H 8.00 0.40 2 100 HH
212 D013 Y 8.00 0.40 2 100 YY
213 D014 G 8.00 0.40 2 100 GG
214 D015 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
215 D016 F 8.00 0.40 2 100 FF
216 D017 T 8.00 0.40 2 100 TT
217 D018 C 8.00 0.40 2 100 CC
218 D019 E 8.00 0.40 2 100 EE
219 D020 G 8.00 0.40 2 100 GG
220 D021 C 8.00 0.40 2 100 CC
221 D022 K 8.00 0.40 2 100 KK
222 D023 S 8.00 0.40 2 100 SS
223 D024 F 8.00 0.40 2 100 FF
224 D025 F 8.00 0.40 2 100 FF
225 D026 K 8.00 0.40 2 100 KK
226 D027 R 8.00 0.40 2 100 RR
227 D028 S 8.00 0.40 2 100 SS
228 D029 V 8.00 0.40 2 100 VV
229 D030 R 8.00 0.40 2 100 RR
230 D031 R 8.00 0.40 2 100 RR
231 D032 N 8.00 0.40 2 100 NN
232 D033 L 8.00 0.40 2 100 LL
233 D034 T 8.00 0.40 2 100 TT
234 D035 Y 8.00 0.40 2 100 YY
235 D036 S 8.00 0.40 2 100 SS
236 D037 C 8.00 0.40 2 100 CC
237 D038 R 8.00 0.40 2 100 RR
238 D039 G 8.00 0.40 2 100 GG
239 D040 S 8.00 0.40 2 100 SS
240 D041 R 8.00 0.40 2 100 RR
241 D042 N 8.00 0.40 2 100 NN
242 D043 C 8.00 0.40 2 100 CC
243 D044 P 8.00 0.40 2 100 PP
244 D045 I 8.00 0.40 2 100 II
245 D046 D 8.00 0.40 2 100 DD
246 D047 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
247 D048 H 8.00 0.40 2 100 HH
248 D049 H 8.00 0.40 2 100 HH
249 D050 R 8.00 0.40 2 100 RR
250 D051 N 8.00 0.40 2 100 NN
251 D052 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
252 D053 C 8.00 0.40 2 100 CC
253 D054 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
254 D055 Y 8.00 0.40 2 100 YY
255 D056 C 8.00 0.40 2 100 CC
256 D057 R 8.00 0.40 2 100 RR
257 D058 L 8.00 0.40 2 100 LL
258 D059 K 8.00 0.40 2 100 KK
259 D060 K 8.00 0.40 2 100 KK
260 D061 C 8.00 0.40 2 100 CC
261 D062 L 8.00 0.40 2 100 LL
262 D063 K 8.00 0.40 2 100 KK
263 D064 M 8.00 0.40 2 100 MM
264 D065 G 8.00 0.40 2 100 GG
265 D066 M 8.00 0.40 2 100 MM
266 0 R 1.01 0.10 2 100 RR
267 0 R 1.01 0.10 2 100 RR
268 0 E 1.01 0.10 2 100 EE
269 0 A 1.45 0.08 2 100 AA
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543 0 A 0.70 0.05 2 77 MA
## FULL FILE NAMES
1 svp -- Steroid receptor seven-up, isoforms B/C.
2 svp -- Steroid receptor seven-up, isoform A.
//
