NucleaRDB 2E4 Dissatisfaction
2005, NucleaRDB.
SEQLENGTH 693
NALIGN 2
REMARK : WARNING: This alignment was generated fully automatically.
REMARK : It therefore highly likely that this alignment contains errors.
REMARK : We give no guarantees and can not be held responsible for errors.
REMARK : Small characters indicate insertions in the sequences relative
REMARK : to the profile ocurred.
Date= 2005-04-20 19:47:59
NOTATION : NR : Number of the sequence in the database.
NOTATION : ID : Identifier of the sequence.
NOTATION : STRID : Not relevant in this case.
NOTATION : %ID : Percent of residues identical with the consensus sequence.
NOTATION : %SIM : Convolution of sequence with profile
NOTATION : IFIR,ILAS : Not used.
NOTATION : JFIR,JLAS : Not used.
NOTATION : LALI : Not used.
NOTATION : NGAP : Not used.
NOTATION : LGAP : Not used.
NOTATION : LSEQ2 : Total length of the seq.
NOTATION : SEQW : Weight of the seq.
## PROTEINS : EMBL/SWISSPROT identifier and alignment statistics
NR. ID %IDE %SIM IFIR ILAS JFIR JLAS LALI NGAP LGAP LSEQ2 ACCNUM SEQW PROTEIN
1 : O96680_DROME 1.00 1.00 0 0 0 0 0 0 0 693 O96680 1.0000 dsf -- Dissatisfaction.
2 : Q9VML1_DROME 0.99 1.00 0 0 0 0 0 0 0 691 Q9VML1 1.0000 dsf -- CG9019-PA.
## ALIGNMENTS 1 - 2
SeqNo PDBNo AA STRUCT Gap-O Gap-E ACC NOCC VAR ....:....1....:....2....:....3....:....4....:....5....:....6....:....7
1 0 M 1.00 0.05 2 100 MM
2 0 G 1.00 0.05 2 100 GG
3 0 T 1.00 0.05 2 100 TT
4 0 A 1.00 0.05 2 100 AA
5 0 G 1.00 0.05 2 100 GG
6 0 D 1.00 0.05 2 100 DD
7 0 R 1.00 0.05 2 100 RR
8 0 L 1.00 0.05 2 100 LL
9 0 L 1.00 0.05 2 100 LL
10 0 D 1.00 0.05 2 100 DD
11 0 I 1.00 0.05 2 100 II
12 0 P 1.00 0.05 2 100 PP
13 D001 C 8.00 0.40 2 100 CC
14 D002 K 8.00 0.40 2 100 KK
15 D003 V 8.00 0.40 2 100 VV
16 D004 C 8.00 0.40 2 100 CC
17 D005 G 8.00 0.40 2 100 GG
18 D006 D 8.00 0.40 2 100 DD
19 D007 R 8.00 0.40 2 100 RR
20 D008 S 8.00 0.40 2 100 SS
21 D009 S 8.00 0.40 2 100 SS
22 D010 G 8.00 0.40 2 100 GG
23 D011 K 8.00 0.40 2 100 KK
24 D012 H 8.00 0.40 2 100 HH
25 D013 Y 8.00 0.40 2 100 YY
26 D014 G 8.00 0.40 2 100 GG
27 D015 I 8.00 0.40 2 100 II
28 D016 Y 8.00 0.40 2 100 YY
29 D017 S 8.00 0.40 2 100 SS
30 D018 C 8.00 0.40 2 100 CC
31 D019 D 8.00 0.40 2 100 DD
32 D020 G 8.00 0.40 2 100 GG
33 D021 C 8.00 0.40 2 100 CC
34 D022 S 8.00 0.40 2 100 SS
35 D023 G 8.00 0.40 2 100 GG
36 D024 F 8.00 0.40 2 100 FF
37 D025 F 8.00 0.40 2 100 FF
38 D026 K 8.00 0.40 2 100 KK
39 D027 R 8.00 0.40 2 100 RR
40 D028 S 8.00 0.40 2 100 SS
41 D029 I 8.00 0.40 2 100 II
42 D030 H 8.00 0.40 2 100 HH
43 D031 R 8.00 0.40 2 100 RR
44 D032 N 8.00 0.40 2 100 NN
45 D033 R 8.00 0.40 2 100 RR
46 D034 I 8.00 0.40 2 100 II
47 D035 Y 8.00 0.40 2 100 YY
48 D036 T 8.00 0.40 2 100 TT
49 D037 C 8.00 0.40 2 100 CC
50 D038 K 8.00 0.40 2 100 KK
51 D039 A 8.00 0.40 2 100 AA
52 D040 T 8.00 0.40 2 100 TT
53 D041 G 8.00 0.40 2 100 GG
54 D042 D 8.00 0.40 2 100 DD
55 D043 L 8.00 0.40 2 100 LL
56 D044 K 8.00 0.40 2 100 KK
57 D045 G 8.00 0.40 2 100 GG
58 D046 R 8.00 0.40 2 100 RR
59 D047 C 8.00 0.40 2 100 CC
60 D048 P 8.00 0.40 2 100 PP
61 D049 V 8.00 0.40 2 100 VV
62 D050 D 8.00 0.40 2 100 DD
63 D051 K 8.00 0.40 2 100 KK
64 D052 T 8.00 0.40 2 100 TT
65 D053 H 8.00 0.40 2 100 HH
66 D054 R 8.00 0.40 2 100 RR
67 D055 N 8.00 0.40 2 100 NN
68 D056 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
69 D057 C 8.00 0.40 2 100 CC
70 D058 R 8.00 0.40 2 100 RR
71 D059 A 8.00 0.40 2 100 AA
72 D060 C 8.00 0.40 2 100 CC
73 D061 R 8.00 0.40 2 100 RR
74 D062 L 8.00 0.40 2 100 LL
75 D063 A 8.00 0.40 2 100 AA
76 D064 K 8.00 0.40 2 100 KK
77 D065 C 8.00 0.40 2 100 CC
78 D066 F 8.00 0.40 2 100 FF
79 D067 Q 8.00 0.40 2 100 QQ
80 D068 S 8.00 0.40 2 100 SS
81 D069 A 8.00 0.40 2 100 AA
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265 0 H 1.00 0.05 2 100 HH
266 0 N 1.00 0.05 2 100 NN
267 0 L 1.00 0.05 2 100 LL
268 0 I 1.00 0.05 2 100 II
269 0 A 1.00 0.05 2 100 AA
270 0 E 1.00 0.05 2 100 EE
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